中国水利水电科学研究院是国内最早开展建设项目环境影响评价工作的单位之一，最早于1986年12月15日获得国家环境保护局颁发的环评资质证书，当前，我院拥有“国环评证甲字第1024号”的环评甲级资质，曾经作为国家环境保护部推荐的建设项目竣工环境保护验收调查单位（2009年）；作为建设项目竣工环境保护验收技术规范编制单位，编制了《建设项目竣工环境保护验收技术规范 水利水电》（HJ464-2009）。本单位主要面向全国的大中型水利水电工程开展建设项目环境影响评价、建设项目竣工环境保护验收及相关专题咨询研究等工作。近几年，我院完成的国家重大水利水电建设项目的环境影响评价及竣工环保验收达30～40项，其它各类相关方面的科学研究项目40～50项。其中，近年完成的环保验收项目主要有：黄河万家寨水利枢纽工程竣工环境保护验收环境调查报告、黄河小浪底水利枢纽配套工程西霞院反调节水库竣工环保验收调查报告、亚行贷款黄河防洪项目竣工环保验收调查报告、淮河入海水道近期工程竣工环保验收调查报告、疏勒河农业灌溉移民安置综合开发项目环保验收调查报告、四川省南桠河栗子坪水电站工程竣工环保验收调查报告等。